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環(huán)二鳥(niǎo)苷酸(c-di-GMP)是由鳥(niǎo)苷三磷酸在二鳥(niǎo)苷酸環(huán)化酶的作用下環(huán)化而形成的,這個(gè)反應(yīng)的過(guò)程還需要有Mg2+作為輔助因子,以確保反應(yīng)酶的活性。c-di-GMP作為細(xì)菌中的第二信使分子,參與調(diào)節(jié)多種生理功能,比如細(xì)胞分化,生物被膜形成,致病因子產(chǎn)生等。它的作用機(jī)制是通過(guò)二鳥(niǎo)苷環(huán)化酶(DGC)合成和磷酸二酯酶(PDE)的降解途徑進(jìn)行調(diào)控的。c-di-GMP的化學(xué)式為C20H24N10O14P2,分子量為690.41。
檢測(cè)方法:高效液相色譜(HPLC)法,液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS),酶聯(lián)免疫吸附(ELISA)法等。以HPLC為例,簡(jiǎn)單的介紹一下檢測(cè)流程。
1.樣品處理
根據(jù)樣品中種類(lèi),如血清,血漿,細(xì)胞上清,組織勻漿等。采用不同的方法,去除雜質(zhì),超聲,離心,膜過(guò)濾,待測(cè)。具體操作過(guò)程和方法,需參考相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)、文獻(xiàn)或開(kāi)發(fā)出來(lái)。
2.色譜條件
常規(guī)的C18反相色譜柱,250mmx4.6mm,5um,柱溫25℃;紫外檢測(cè)器,波長(zhǎng)253nm;以乙酸銨和乙酸銨甲醇為流動(dòng)相,梯度洗脫,流速0.8-1ml/min,進(jìn)樣量10-20uL。僅供參考,需要重新驗(yàn)證或調(diào)整參數(shù),獲得適合實(shí)際環(huán)境情況的最佳條件。
3.標(biāo)準(zhǔn)曲線
將c-di-GMP的標(biāo)準(zhǔn)品用水進(jìn)行溶解和稀釋?zhuān)渲瞥蓸?biāo)準(zhǔn)母液,記錄它的濃度值。然后,梯度稀釋5-7個(gè)點(diǎn),可以成倍的進(jìn)行,確保覆蓋到樣品溶液中的目標(biāo)化合物可能濃度范圍。最低點(diǎn)一般是在定量限,以信噪比(S/N)的10倍確定。依次進(jìn)樣到HPLC中,測(cè)出各個(gè)點(diǎn)的色譜峰,記錄它的保留時(shí)間。對(duì)各個(gè)峰的峰面積進(jìn)行積分處理,并結(jié)合它的濃度,擬合出標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到回歸方程。
4.含量計(jì)算
樣品溶液進(jìn)樣到HPLC中,在軟件中記錄色譜峰。由于樣品是復(fù)雜的,沒(méi)有標(biāo)品那么純正,因?yàn)榭赡軙?huì)出現(xiàn)雜峰。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)色譜峰的保留時(shí)間,找到樣品中目標(biāo)色譜峰的位置,并對(duì)它的峰面積進(jìn)行手工或自動(dòng)積分處理。將樣品的c-di-GMP的色譜峰面積代入到回歸方程,可計(jì)算出樣品溶液中的c-di-GMP的含量。